Untuk menjamin keamanan seluruh civitas akademika, UMKU memiliki Satuan Pengamanan yang bekerja 24 jam di seluruh area kampus dengan pembagian jam kerja yaitu setiap 8 jam dijaga dengan 8 Personil satuan pengamanan. Hal itu diperkuat dengan adanya Juru Parkir yang tersebar diseluruh area parkir fakultas-fakultas dilingkungan Universitas Muhammadiyah Kudus. Juru parkir bertugas mengontrol dan menjaga keamanan di masing – masing are parkirnya. Dan seluruh civitas akademikan juga dikontrol STNK kendaraannya ketika akan keluar dari area parkir dan area UMKU.
